İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı Yasa Dışı Bahis ve Spor Suçları Bürosu'nun 'eziyet', 'resmi belgede sahtecilik', 'güveni kötüye kullanma' ve 'kişisel verileri hukuka aykırı ele geçirme' suçlamalarıyla yürüttüğü hakemler dosyasında Gündoğdu'ya ilk olarak klasman değişiklikleri soruldu. 8 Mart 2022'de ligler sürerken çok sayıda hakem ve gözlemcinin klasman dışına çıkarılmasının gerekçesini anlatan Gündoğdu, kararın kamuoyu ve kulüplerden gelen talepler sonrasında TFF Yönetim Kurulu'nun iradesiyle, hukuk birimlerinin de değerlendirmesi alınarak uygulandığını söyledi.
Çok sayıda hakemin Tahkim Kurulu'na başvurduğu, önemli bölümünün göreve iade edildiği ve Gündoğdu'nun da kısa süre sonra görevinden ayrıldığı belirtildi. Tahkim tarafından 2022'de göreve döndürülen Burak Şeker, Abdulkadir Bitigen, Alpaslan Dedeş, Hüseyin Göçek, Mert Güzenge, Murat Erdoğan, Alper Ulusoy, Bahattin Şimşek, İsmail Şencan, Koray Gençerler ve Mesut Çarık gibi bazı isimlerin 2024'te yeniden liste dışı kalması da aynı örüntü üzerinden soruldu ve bu durum dosyanın temel inceleme başlıklarından biri olarak görülüyor.
Gündoğdu kişisel husumet veya intikam saikiyle hareket etmediğini, kararların MHK tarafından kolektif alındığını ve TFF yönetiminin onayından geçtiğini söyledi. 2024-2025 sezonunda ilk klasman listesinden sonra ikinci bir liste yayımlanması da sorulan konular arasındaydı. Müşteki ve tanıklar ilk listede yer alan bazı isimlerin kısa süre sonra çıkarıldığını ve kendilerine somut bir gerekçe bildirilmediğini anlatıyor, ifadelerde 13 hakem ve 6 gözlemcinin sonradan liste dışına çıkarıldığı yönündeki anlatımlar tekrar ediyor.
Gündoğdu bu değişikliklerin performans, ihtiyaç ve MHK değerlendirmesi çerçevesinde yapıldığını savundu. Süleyman Abay, Taner Gizlenci ve Emre Altun gibi isimlerin anlatımlarında ise 2015'teki bazı Trabzonspor karşılaşmalarında görev yapan isimlerin yıllar sonra aynı klasman değişikliklerinde dışarıda bırakıldığı belirtiliyor, Gündoğdu bunu hedefli bir tasfiye olarak kabul etmiyor.
